Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms