Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sys1Q78S06 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sys1Q78S06 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms