Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms