Protein–RNA interactions for Protein: Q76EC5

Chst9, Carbohydrate sulfotransferase 9, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst9Q76EC5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Chst9Q76EC5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms