Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms