Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trak1Q6PD31 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms