Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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