Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms