Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt40Q6IFX3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms