Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atg9aQ68FE2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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