Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms