Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms