Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms