Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms