Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tsr1Q5SWD9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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