Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem40Q4FJU9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem40Q4FJU9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem40Q4FJU9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem40Q4FJU9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem40Q4FJU9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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