Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms