Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms