Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms