Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nhlrc4Q3UP44 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms