Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms