Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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