Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp19Q3UJD6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp19Q3UJD6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms