Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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