Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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