Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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