Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms