Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim24Q0VG18 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim24Q0VG18 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms