Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem52bQ0VBF2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms