Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms