Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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