Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MestQ07646 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MestQ07646 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms