Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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