Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms