Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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NfiaQ02780 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms