Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms