Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms