Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms