Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Serpina1cQ00896 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms