Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms