Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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