Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3aP97351 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms