Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms