Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms