Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tp53bp1P70399 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tp53bp1P70399 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tp53bp1P70399 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tp53bp1P70399 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tp53bp1P70399 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tp53bp1P70399 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tp53bp1P70399 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tp53bp1P70399 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tp53bp1P70399 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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