Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb13P70321 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms