Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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UbdP63072 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UbdP63072 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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UbdP63072 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UbdP63072 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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UbdP63072 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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