Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps18P62270 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms