Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vbp1P61759 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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