Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms